Vers Owlready 2... !

Owlready est un module Python pour la programmation orientée ontologie. La version 2 actuellement en cours de développement reprend les fonctionnalités de la première version, en s'appuyant cette fois ci sur un 'quadstore' RDF optimisé en SQL. Cette version est désormais capable de gérer de grosses ontologies (plusieurs millions de triplets RDF) avec un bon niveau de performances.

La version de développement d'Owlready2 est disponible ici : https://bitbucket.org/jibalamy/owlready2

ORMithorynque 0.1.1 est disponible !

ORMithorynque est un module d'ORM pour Python (base de données objet).

ORMithorynque 0.1.1 est disponible et peut être télécharger sur PyPI (Python Package Index) : https://pypi.python.org/pypi/ORMithorynque

Utiliser Webex sous ArchLinux

Webex est un système de vidéoconférence de Cisco. Il fonctionne sous Linux mais n'est disponible qu'en version 32 bits... Ce tutoriel explique comment l'utiliser sous ArchLinux 64 bits.

1- Installer Firefox (32 bits), Java (32 bits) et les dépendances 32 bits de webex

Installer la version 32 bits de Firefox, de Java, et les librairies 32 bits dont dépend Webex. Pour ArchLinux, il s'agit des paquets AUR bin32-firefox, bin32-jre, webex-meta.

2- Tester Java dans Firefox

Lancer Firefox 32 bits et tester l'installation de Java à partir de cette page : https://java.com/fr/download/installed8.jsp

Si le plugin Java n'est pas trouvé par Firefox, vérifier la présence du plugin (fichier /usr/lib32/mozilla/plugins/libnpjp2-jre8.so) et démarer Firefox en spécifiant le répertoire des plugins de la manière suivante :

MOZ_PLUGIN_PATH=/usr/lib32/mozilla/plugins/ /usr/lib32/bin32-firefox/firefox32

3- Tester Webex

Tester Webex à partir de la page suivante : https://www.webex.fr/test-meeting.html

Attention, le lancement de l'interface ne suffit pas à "réussir" le test. Il faut attendre d'avoir l'écran suivant :

(Voir les commentaires...)

OwlReady à la conférence STC 2016

OwlReady et la programmation orientée ontologie ont fait l'objet d'une présentation à la conférence STC 2016 (Special Topic Conference). L'article est disponible en ligne et la présentation de même. Merci de citer ce papier si vous utilisez OwlReady !

Ontology-Oriented Programming for Biomedical Informatics.
JB Lamy.
Studies in Health Technology and Informatics 2016 ; 221:64-68

Owlready est un module Python pour la programmation orientée ontologie. Il permet de charger des ontologies OWL 2.0 et de les manipuler de manière transparente en Python.

Owlready 0.2 est disponible !

Owlready est un module Python pour la programmation orientée ontologie. Il permet de charger des ontologies OWL 2.0 et de les manipuler de manière transparente en Python.

La version 0.2 d'Owlready corrige des problèmes sous Windows lors de l'exécution du raisonneur HermiT. Elle peut être télécharger sur PyPI (Python Package Index) : https://pypi.python.org/pypi/Owlready

Owlready 0.1.1 est disponible !

Owlready est un module Python pour la programmation orientée ontologie. Il permet de charger des ontologies OWL 2.0 et de les manipuler de manière transparente en Python.

La version 0.1.1 d'Owlready corrige des problèmes d'installation rencontrés sur certaines configurations, liés à l'installation des fichiers "hermit" et "locale". Elle peut être télécharger sur PyPI (Python Package Index) : https://pypi.python.org/pypi/Owlready

Owlready à la conférence d'ingéniérie des connaissances IC 2015

Owlready a fait l'objet d'un article et d'une présentation à la conférence d'ingéniérie des connaissances (IC 2015) lors de la plateforme PFIA. L'article est disponible sur HAL et la présentation ici même. N'hésitez pas à le citer si vous utilisez Owlready !

Ontopy : programmation orientée ontologie en Python
JB Lamy, H Berthelot
IC2015

Owlready est un module Python pour la programmation orientée ontologie. Il permet de charger des ontologies OWL 2.0 et de les manipuler de manière transparente en Python.

Owlready 0.1 est disponible !

Owlready est un module Python pour la programmation orientée ontologie. Il permet de charger des ontologies OWL 2.0 et de les manipuler de manière transparente en Python.

Owlready 0.1 est disponible et peut être télécharger sur PyPI (Python Package Index) : https://pypi.python.org/pypi/Owlready

PyMedTermino à la conférence européenne d'informatique médicale MIE 2015

PyMedTermino a fait l'objet d'un article et d'une présentation à la conférence européenne d'informatique médicale (MIE 2015). L'article est disponible en ligne et la présentation ici même. N'hésitez pas à le citer si vous utilisez PyMedTermino !

PyMedTermino: an open-source generic API for advanced terminology services.
JB Lamy, A Venot, C Duclos.
Studies in Health Technology and Informatics 2015 ; 210:924-928

PyMedTermino (Terminologies Médicales en Python) est un module Python permettant d'accéder facilement aux principales terminologies médicales.

PyMedTermino 0.3.2 est disponible !

PyMedTermino (Terminologies Médicales en Python) est un module Python permettant d'accéder facilement aux principales terminologies médicales.

PyMedTermino 0.3.2 est disponible ; cette version est une mise à jour qui corrige plusieurs bogues sur le module CIM10 ainsi qu'une (très légère) fuite de mémoire.

À télécharger sur PyPI (Python Package Index) : https://pypi.python.org/pypi/PyMedTermino

PyMedTermino 0.3.1 est disponible !

PyMedTermino (Terminologies Médicales en Python) est un module Python permettant d'accéder facilement aux principales terminologies médicales.

PyMedTermino 0.3.1 est disponible ; cette version est une mise à jour qui supporte la dernière version de la SNOMED CT (2015) ainsi que de la CIM10 (les traductions et extensions françaises de l'ATIH sont désormais utilisées). Cette version étend aussi le support de la base Thériaque aux classes chimiques et pharmacologiques, aux substances actives et auxiliaires, ainsi qu'aux correspondances entre ces éléments. Enfin, un système d'ordre entre icône VCM est défini. Elle corrige aussi plusieurs bogues.

À télécharger sur PyPI (Python Package Index) : https://pypi.python.org/pypi/PyMedTermino

BibReview 0.2

BibReview est un logiciel de gestion de base bibliographique. Voici la dernière version 0.2. Cette version fixe plusieurs problèmes liées à la fusion de bases de langues différentes. Elle est désormais disponible sur PyPI : https://pypi.python.org/pypi/BibReview !

(Voir les commentaires...)

éClaircie 0.2

Cette seconde version d' éClaircie, le moteur de blog statique et sans nuage, corrige de nombreux bugs, et ajoute la possibilité d'associer un message à plusieurs catégories, en utilisant des liens symboliques. Vous pouvez la télécharger ici : Téléchargement sur PyPI.

PyMedTermino 0.3 est disponible !

PyMedTermino (Terminologies Médicales en Python) est un module Python permettant d'accéder facilement aux principales terminologies médicales.

PyMedTermino 0.3 est disponible ; cette version ajoute deux nouvelles terminologies : MedDRA et CDF (le thésaurus de la banque de données Thériaque sur le médicament). Elle corrige aussi plusieurs bogues.

Il peut être télécharger sur PyPI (Python Package Index) : https://pypi.python.org/pypi/PyMedTermino