Owlready2 0.20 est disponible !
Owlready2 est un module Python pour la programmation orientée ontologie. Il permet de charger des ontologies OWL 2.0 et de les manipuler de manière transparente en Python.
Cette nouvelle version corrige un bogue important dans le support d'UMLS.
De plus, elle ne considère plus comme fonctionnelles les propriétés associées à des restrictions de type exactly-1 ou max-1. Cette fonctionnalité s'avère en pratique plus gênante qu'autre chose. Si nécessaire, vous pouvez revenir au comportement précédent de la manière suivante :
import owlready2.prop owlready2.prop.RESTRICTIONS_AS_FUNCTIONAL_PROPERTIES = True
Voici les modifications :
Add support for undoable destroy_entity()
Small database optimizations
No longer treat properties associated with exactly-1 or max-1 restriction as functional properties, returning single values instead of a list
Bugfixes: - Fix performance bug on UMLS mapping in PyMedTermino
La nouvelle version peut être téléchargé sur PyPI (Python Package Index) : https://pypi.python.org/pypi/Owlready2
Owlready2 0.19 est disponible !
Owlready2 est un module Python pour la programmation orientée ontologie. Il permet de charger des ontologies OWL 2.0 et de les manipuler de manière transparente en Python.
Cette nouvelle version apporte un meilleur support de SPARQL, des recherches plus rapides et ajoute la syntaxe "individu.INVERSE_propriété". Elle supporte également le nouveau format de fichier compressé UMLS.
Voici les modifications :
Consider symmetric properties as their own inverse properties
Update Python objects after basic SPARQL update/delete queries (works on user-defined properties, hierarchical properties (type/subclassof) and equivalence properties)
Add individual.INVERSE_property
Add Class.INDIRECT_is_a
INDIRECT_is_a / INDIRECT_is_instance_of now include class contructs. ancestors() has a 'include_constructs' parameter, which defaults to False.
Add more aliases for XMLSchema datatypes
Add is_a property to class constructs
Add bottomObjectProperty and bottomDataProperty
Support ReflexiveProperties in individual.INDIRECT_property
Optimize Thing.subclasses()
Optimize search() with multiple criteria, including those done by PyMedTermino
Add support for destroy_entity(SWRL_rule)
Add support for UMLS "metathesaurus" format in addition to "full" format
Bugfixes: - After reasoning, keep all equivalent classes as parents of individuals (as they may have methods) - Fix IndividualPropertyAtom when creating SWRL rule - Fix SWRL parser - Fix RDF serialization for nested RDF lists - Fix removing inverse property (i.e. Prop.inverse = None) - Fix datetime parsing for date with time zone or milliseconds
La nouvelle version peut être téléchargé sur PyPI (Python Package Index) : https://pypi.python.org/pypi/Owlready2
Owlready2 0.18 est disponible !
Owlready2 est un module Python pour la programmation orientée ontologie. Il permet de charger des ontologies OWL 2.0 et de les manipuler de manière transparente en Python.
Cette nouvelle version corrige le support UMLS sous Windows (problème d'encodage de caractères) dans PyMedTermino2. Elle évite également les duplications de triplets RDF dans le quadstore.
Voici les modifications :
Add UNIQUE constraints for preventing dupplicated RDF triples in the quadstore
Add Individual.INDIRECT_is_a / Individual.INDIRECT_is_instance_of
Add isinstance_python() (faster than isinstance(), but do not consider equivalent_to relations)
Bugfixes: - Force UTF-8 encoding when importing UMLS - Be more tolerant when loading OWL file
La nouvelle version peut être téléchargé sur PyPI (Python Package Index) : https://pypi.python.org/pypi/Owlready2
Owlready2 0.17 est disponible !
Owlready2 est un module Python pour la programmation orientée ontologie. Il permet de charger des ontologies OWL 2.0 et de les manipuler de manière transparente en Python.
Cette nouvelle version supporte l'édition des règles SWRL et corrige des problème dans PyMedTermino2.
Voici les modifications :
SWRL rule support
Allows importing UMLS suppressed terms
Uncache entities when relaoding an ontology
Bugfixes: - Fix PyMedTermino2 installation - Fix data property value inferrence with debug = 1 - Fix sort() in LazyList (thanks fiveop!) - Fix World.get() and add World.get_if_loaded() - Add appropriate error message when importing UMLS with Python 3.6 - Fix individuals belonging to multiple, equivalent, classes after reasoning
La nouvelle version peut être téléchargé sur PyPI (Python Package Index) : https://pypi.python.org/pypi/Owlready2
Owlready2 0.16 est disponible !
Owlready2 est un module Python pour la programmation orientée ontologie. Il permet de charger des ontologies OWL 2.0 et de les manipuler de manière transparente en Python.
Cette nouvelle version corrige plusieurs bogues et supporte les requêtes SPARQL de type INSERT et DELETE.
Voici les modifications :
Optimize nested searches
search(sublclass_of = xxx) now returns xxx itself in the results
Support "with long_ontology_name as onto" syntax
In UMLS import, add optional parameters for preventing extraction of attributes, relations, etc
Support SPARQL INSERT queries
Optimize Pymedtermino mapping
Doc for PyMedTermino2
Bugfixes: - Fix 'Cannot release un-acquired lock' error when reasoning on inconsistent ontologies inside a 'with' statement - Fix bug when loading a property that refers to another property from a quadstore stored on disk - Fix RDF triple suppression with RDFlib when object is a datatype
La nouvelle version peut être téléchargé sur PyPI (Python Package Index) : https://pypi.python.org/pypi/Owlready2
Owlready2 0.15 est disponible !
Owlready2 est un module Python pour la programmation orientée ontologie. Il permet de charger des ontologies OWL 2.0 et de les manipuler de manière transparente en Python.
Cette nouvelle version corrige principalement les bogues de la 0.14.
Voici les modifications :
Can infer data property values when reasoning with Pellet
Optimize searches with 'type =', 'subclass_of =', or 'is_a =' parameters
Add Property.range_iri
Add _case_sensitive parameter to search()
Add inverse property support in RDFlib support
Show Java error message when reasoners crash
Bugfixes: - Consider inverse property in get_properties() - Fix parsing bug in reasoning with HermiT and infer_property_values = True - Namespace prefix support in RDFlib binding - Fix dupplicates values when a relation involving a property with inverse is asserted in both directions - Better workaround in case of metaclass conflict - Fix 'sqlite3.OperationalError: too many SQL variables' in searches with 'type =', 'subclass_of =', or 'is_a =' parameters
La nouvelle version peut être téléchargé sur PyPI (Python Package Index) : https://pypi.python.org/pypi/Owlready2
Owlready2 0.14 est disponible !
Owlready2 est un module Python pour la programmation orientée ontologie. Il permet de charger des ontologies OWL 2.0 et de les manipuler de manière transparente en Python.
Cette nouvelle version apporte la possibilité d'inférer les valeurs des propriétés (comme dans Protégé) et d'utiliser des règles SWRL, et une meilleure gestion des propriétés de classe et le support d'UMLS (la documentation reste à faire !). Elle corrige aussi plusieurs bogues.
Voici les modifications de la version 0.14 :
UMLS support (owlready2.pymedtermino2 package)
Can infer object property values when reasoning (thanks W Zimmer)
New implementation of property values; use INDIRECT_prop to get indirect values
Support several class property types : some, only, some + only, and direct relation
Automatically create defined classes via class properties
Support anonymous individuals, e.g. Thing(0)
Optimize search() when only the number of returned elements is used
Optimize FTS search() when using also non-FTS statements
Can restrict reasoning to a list of ontologies
Union searches (i.e. default_world.search(...) | default_world.search(...))
Bugfixes: - Fix functional class properties with inheritance - Fix dupplicated instance list restrictions when calling close_world(ontology) - Fix use of '*' in search - Fix synchronization, using contextvars for global variables
La nouvelle version peut être téléchargé sur PyPI (Python Package Index) : https://pypi.python.org/pypi/Owlready2
Owlready2 0.13 est disponible !
Owlready2 est un module Python pour la programmation orientée ontologie. Il permet de charger des ontologies OWL 2.0 et de les manipuler de manière transparente en Python.
Cette nouvelle version corrige plusieurs bogues et diminutions de performance liés aux nouveaux quadstore introduit dans la version précédente.
Voici les modifications de la version 0.13 :
Bugfixes: - Fix performance regression due to suboptimal index in the quadstore - Fix messing up with IRI ending with a / - Fix error in World cloning - Fix the addition of Thing in class's parent when redefining a class with Thing as the only parent - Fix inverse_resctriction() - Add error message when creating an existent quadstore
La nouvelle version peut être téléchargé sur PyPI (Python Package Index) : https://pypi.python.org/pypi/Owlready2
Owlready2 0.12 est disponible !
Owlready2 est un module Python pour la programmation orientée ontologie. Il permet de charger des ontologies OWL 2.0 et de les manipuler de manière transparente en Python.
Cette nouvelle version majeure utilise un nouveau quadstore plus performant, testé jusqu'à 200 millions de triplets RDF (sur DBpedia). Le support de PostgresQL a été retiré car son intérêt était très limité (les performances étant bien moins bonnes qu'avec Sqlite3).
Voici les modifications de la version 0.12 :
New quadstore
Numerical search (NumS, e.g. all patients with age > 65)
Nested searches
Synchronization for multithreading support
Add Class.inverse_restrictions() and Class.direct_instances()
Drop PostgresQL support (little interest: more complex and slower than Sqlite3)
Bugfixes: - Fix call to _get_by_storid2 - Fix rdfs_subclassof in doc - Fix FTS triggers - Fix boolean in RDFlib / SPARQL - Fix bug when destroying an AnnotationProperty
La nouvelle version peut être téléchargé sur PyPI (Python Package Index) : https://pypi.python.org/pypi/Owlready2
Owlready2 0.11 est disponible !
Owlready2 est un module Python pour la programmation orientée ontologie. Il permet de charger des ontologies OWL 2.0 et de les manipuler de manière transparente en Python.
Cette nouvelle version apporte deux nouveautés majeures : le support du raisonneur Pellet et la recherche plein-texte optimisée.
Voici les modifications de la version 0.11 :
Optimized Full-Text Search
Support Pellet reasoner in addition to HermiT
Support loading of huge OWL files (incremental load)
Use Class.property.indirect() for indirect Class property (instead of Class.property)
Add reload and reload_if_newer parameters to Ontology.load()
search() is now much faster on properties that have inverse
Add shortcut for SOME ConstrainedDatatype: e.g. age >= 65
Bugfixes: - Fix creation of an individual that already exists in the quadstore - Fix missing import of EntityClass in class_construct.py - Fix World.save() with RDF/XML format - Fix Thing.subclasses() and Thing.descendants() - Fix ontology's update time for ontologies created de novo in Python with Owlready - Fix reasoning when asserting new parents with equivalent classes
La nouvelle version peut être téléchargé sur PyPI (Python Package Index) : https://pypi.python.org/pypi/Owlready2
Owlready2 0.10 est disponible !
Owlready2 est un module Python pour la programmation orientée ontologie. Il permet de charger des ontologies OWL 2.0 et de les manipuler de manière transparente en Python.
Cette nouvelle version corrige de nombreux bogues et apporte le support des métadonnées de l'ontologie. Elle introduit aussi l'utilisation de Cython, pour accélérer la lecture des fichiers RDF/XML et OWL/XML. Owlready2 est désormais capable de charger ces fichiers aussi rapidement que Java !
Voici les modifications de la version 0.10 :
Add Ontology.metadata for adding/querying ontology metadata
Allows multiple individual creations with the same name/IRI, now returning the same individuals
Add OwlReadyInconsistentOntologyError and Word.inconsistent_classes()
Implement RDF/XML and OWL/XML parsing in Cython (25% speed boost for parsing)
Small optimization
Extend individual.prop.indirect() to include relations asserted at the class level
Add .query_owlready() method to RDF graph
Bugfixes: - Fix reasoning when obtaining classes equivalent to nothing - Fix World creation with backend parameters - Fix error when adding property at the class definition level - Fix loading of ontology files with no extension from onto_path - Fix properties defined with type 'RDF Property' and subproperty of 'OWL Data/Object/Annotation Property' - Support old SQLite3 versions that do not accept WITHOUT ROWID - Fix reference to undeclared entities (they were replaced by None, now by their IRI) - Fix loading and saving ontologies whose base IRI ends with / - Fix RDF query using string
La nouvelle version peut être téléchargé sur PyPI (Python Package Index) : https://pypi.python.org/pypi/Owlready2
Owlready2 0.9 est disponible !
Owlready2 est un module Python pour la programmation orientée ontologie. Il permet de charger des ontologies OWL 2.0 et de les manipuler de manière transparente en Python.
Cette nouvelle version permet d'utiliser PostgresQL à la place de SQLite3 (cependant les performances sont généralement moins bonnes). Elle facilite également l'accès aux restrictions de type SOME sur les classes, en utilisant la notation pointée "classe.propriété".
Voici les modifications de la version 0.9 :
PostgresQL backend (in addition to SQLite3)
Add 'exclusive = False' option for SQLite3 backend (slower, but allows multiple uses)
Use unique index in sqlite3 quadstore on resources table
Optimize sqlite3 quadstore by caching IRI dict (5% faster)
Add == support for class construct
Add get_namespace() support on World
Add 'existential restrictions as class properties' feature
Bugfixes: - Fix imported ontologies - Fix saving ontologies in onto_path - Fix clear() on CallbackList - Fix bug in Class IRI in ontologies whose base IRI ends with a / - Fix imported ontologies in ontologies whose base IRI ends with a /
La nouvelle version peut être téléchargé sur PyPI (Python Package Index) : https://pypi.python.org/pypi/Owlready2
Le grand tableau des ontologies
Ce grand tableau récapitule 5 notations utilisées pour les ontologies formelles en OWL : les logiques de description, la syntaxe de l'éditeur Protégé, la syntaxe d'Owlready2 en Python, et la sémantique en logique du premier ordre et en logique ensembliste. À garder à portée de main quand on travail sur les ontologies formelles !
Vous pouvez télécharger le grand tableau des ontologies (the great table of ontologies).
Owlready2 0.8 est disponible !
Owlready2 est un module Python pour la programmation orientée ontologie. Il permet de charger des ontologies OWL 2.0 et de les manipuler de manière transparente en Python.
Voici les modifications des versions 0.6, 0.7 et 0.8 (les deux premières n'ayant duré que quelques heures) :
Add set_datatype_iri() global function for associating a Python datatype to an IRI
Add nquads ontology format (useful for debugging)
Add support for dir() on individuals
Add support for ontology using https: protocol (thanks Samourkasidis Argyrios)
Add observe module (for registering callback when the ontology is modified)
Improve docs
Bugfixes: - Align Python floats with xsd:decimal rather than xsd:double, finally, because decimal accepts int too - Fix Class.instances() so as it returns instances of subclasses (as indicated in the doc) - Fix direct assignation to Ontology.imported_ontologies - Fix a bug in reasoning, when adding deduced facts between one loaded and one non-loaded entity - Fix search(prop = "value") when value is a string and the ontology uses localized string
La nouvelle version peut être téléchargé sur PyPI (Python Package Index) : https://pypi.python.org/pypi/Owlready2